Žemės ūkio paskolų garantijų fondas teikia garantijas (kurių suma vienu metu neviršija Lietuvos Respublikos Vyriausybės tais metais fondui nustatyto valstybės garantijų limito) kredito įstaigoms už kreditus:
 - žemdirbiams;
 - smulkiems ir vidutiniams verslininkams, dirbantiems kaimo vietovėje (ūkio subjektams, užsiimantiems alternatyvia žemės
   ūkiui veikla). Kaimo vietovė - kaimas arba miestas, kuriame gyvena ne daugiau kaip 6 tūkst. gyventojų;
 - įmonėms, superkančioms ir(ar) perdirbančioms, (ir)ar realizuojančioms žemės ūkio produktus;
 - valstybės įmonei Lietuvos žemės ūkio ir maisto produktų rinkos reguliavimo agentūra;
 - kaimo bendruomenėms ir vietos veiklos grupėms, įgyvendinančioms investicijų projektus pagal Lietuvos kaimo plėtros
   2007-2013 metų programos priemones;
 - mokslo ir studijų institucijoms bei profesinio mokymo įstaigoms, turinčioms eksperimentinius, parodomuosius,
   mokomuosius ar bandymų ūkius ir įgyvendinančioms investicijų projektus pagal Lietuvos kaimo plėtros 2007-2013 metų
   programos priemones.

Garantijos už kreditus žemės ūkio veiklos subjektams.
Žemės ūkio veiklos subjektai - tai ūkio subjektai, daugiau kaip pusę pajamų gaunantys iš žemės ūkio produkcijos gamybos ir paslaugų žemės ūkiui:

 - ūkininkų ūkiai;
 - ūkininkų kooperatinės bendrovės;
 - ūkininkų ūkinės bendrijos;
 - žemės ūkio bendrovės;
 - kitos žemės ūkio įmonės.

Garantijos už kreditus ūkio subjektams, užsiimantiems alternatyvia žemės ūkiui veikla.
Ūkio subjektams, užsiimantiems alternatyvia žemės ūkiui veikla, priskiriami visi kaimo vietovėse ar miestuose, kuriuose gyvena ne daugiau kaip 6 tūkst. gyventojų, dirbantys smulkūs ir vidutiniai verslininkai:

 - paslaugų teikimas kaime (agroservisai, kirpyklos, avalynės ir drabužių taisyklos ir pan.),
 - smulkios ar vidutinės žemės ūkio produktų perdirbimo įmonės (mėsos, pieno, grūdų ir kt. maisto produktų perdirbimas),
 - gamybos įmonės,
 - tradiciniai amatai,
 - kaimo turizmas,
 - miškininkystė ir medienos ruoša,
 - kita gamyba kaime.

Garantijos už kreditus perdirbimo įmonėms
Žemės ūkio paskolų garantijų fondas kredito įstaigoms teikia garantijas už kreditus įmonėms mieste, kurios:

superka ir(ar) perdirba,  ir(ar) realizuoja žemės ūkio produktus.

Žemės ūkio paskolų garantijų fondas kredito įstaigoms garantuoja iki 70 proc. negrąžinto kredito ar kreditinės linijos sumos grąžinimą. Jauniems ūkininkams (iki 40 metų amžiaus) teikiamiems kreditams garantuojama iki 80 proc. negrąžinto kredito sumos. Garantijos teikiamos ne didesniems kaip 4 mln. Lt  kreditams.